Windows переустановил. Все прошло успешно. Спасибо VAHA-IT.
Записал на диск Acronis Backup and Recovery и загрузился. C- 100 мб (GRUB или что-то, как рас тот загрузчик), D - диск с виндой, E - данные ntfs, F - ubuntu, G - данные для убунту. Полностью backup-нул С на флешку. переустановил, как обычно деляется, винду на D. Меню выбора ОСей пропало. Перезагрузился с акронисом. Восстановил обратно backup-архив с флешки на С. Все заработало как раньше. Вот так вот кратко кому если поможет.