Не могу понять: а причем тут системный/несистемный, если разговор идет о неработоспособности второго жесткого диска, ведь система грузится на первом, а второй просто не работает, вот и не проходит тест...
И, насколько мне известно: системе совершенно без разницы с какого порта Сата грузиться (или же Ваша материнская плата уникальна)...