Ну если Вы перевели в PDF и у Вас установлен FineReader, то им и действуйте. Либо запускаете саму программу FR, в ней открываете PDF-документ, дальше постранично выделяете область, жмете "Распозать", потом "Сохранить", либо открываете WORD, в нем сверху должен быть ярлычок FineReader, тыкаете в него, выбираете "из файла", открываете Ваш PDF-файл и запускаете процесс.