ну форматировать пока не думаю что нужно - но скачать / или обновить базы вашего антивируса и про сканировать на вирусы нужно .
можно проверится этим в безопасном режиме.
ftp://ftp.drweb.com/pub/drweb/cureit/cureit.exe-
и так же могло произойти после сбоя системы или диска.
попробуйте через другой компьютер (подключить ваш жесткий диск - или с Лайв Линукс диска ( система которая загружается без установки на компьютер) проверить если есть доступ к файлам.
+ есть программы по возврату удаленной информации, которыми так же можно просканировать жесткий диск ( до определенного процента, можно вернуть )