Без разницы на какой файловой системе стоит винда, совсем пофигу, просто 98ая и ME не видит NTFS и NPFS любой категории, а начиная с 2000 и линукс в том числе видит все и со всем работает! Файловая система- ето способ хранения информации и доступа к ней, она не умеет распознавать, распознает винда, а точнее ее ядро.