Скорее всего конфликт с чем то. Какой то антивирусный софт стоит ещё? И до это установки Comodo были какие то проблемы в ОС?
Я ставила Comodo несколько раз на WinXP, работало вроде норм, с настройками по дефолту. Может в настройках чего? Потому что я помню, как то настроила его непонятно, и у меня перестали запускаться .exe вообще и др. проблемы были.