Странно конечно, я встречал такое, что торрент грузит винт на 100% и от этого виснет вся система, но что бы процессор. Мне, почему то, тоже кажется, что дело либо в вирусах, либо просто, что то, где то нарушилось вследствие предыдущих.
Можно попробывать, какие нибудь, програмки которые сбрасывают системные настройки сети.