Перемычка(джампер) на SATA винчестере переключает режимы SATA и SATA2.
Мастер - первое(основное) устройство на IDE шлейфе.
Слейв - второстепенное устройство на IDE шлейфе.
Если на IDE шлейфе подключены два устройства, то они должны быть обозначены обязательно как Мастер и Слейв, иначе Биос не сможет их определить, либо определит только одно из них.