Хорошо с логикой работает LTSpice (IV или XVII, четвертая версия побыстрее, а в 17 больше библиотек). А первоначальный момент (на момент включения) можно задавать командой
.Ic V(метка)=нужное напряжение.
Вот, примерно так. Можно отдельно по входам, каждого триггера, можно все вместе, как у меня.