На все вопросы по ОС один ответ: если в организации есть специалист по Линуху, то делайте. Если нет, то не связывайтесь с этой ОС. Стать специалистом по ОС и информационной безопасности методом тыка не получится. Уж больно дорогое это удовольствие - восстановление утраченной информации. Рекомендую пройти обучение по данным направлениям за счет организации. В конечном счете это будет дешевле.
Чтобы ответить на ваши вопросы по "железу", нужна конкретика. Какая именно материнская плата? Какой процессор? Память? Какие винчестеры собираетесь использовать?