После дефрагментации выполняется оптимизация файлов, все переносятся в начало диска по порядку, при этом затираются точки восстановления, тут все штатно. Покажите s.m.a.r.t. жесткого диска. В командной строке запущенной от имени Администратора введите команду sfc /scannow и нажмите энтер. По окончании сделать скрин окна и выложить в тему.