Внешний жесткий диск монтируется в самой системе, в BIOS его прописывать нет необходимости, кроме случая, если вы на него ОС хотели установить.
Активировать систему не проблема, тем более что советов по этому вопросу в сети превеликое множество.
Если вам нужно переустановить систему, можете стартовать установку из-под текущей системы и выбрать полную установку с удалением старых данных, в этом случае ваш жесткий диск будет отформатирован и на него установится чистая система.