Если всё работает и на SSD имеются два раздела один из них раздел восстановления. То спокойно можешь если на HDD нужной информации нет, то удаляй все разделы и создавай снова. Смотри всё это и делай в управлении дисками. Кстати второй диск случайно не вместо CD стоит?