Скорее всего проблема в двигателе. Может быть КЗ на коллекторе. То что увеличил ёмкость это не критично если напряжение осталось "родным". А вот если увеличил напряжение АКБ, то тут могут возникнуть проблемы... Надеюсь термоконтакт не выкинул?
Пару месяцев назад сделал то-же самое всё работает. Есть ещё подозрение что напряжение на двигатель идёт не напрямую, а через преобразователь. Возможно там проблема...