Может есть смысл глянуть ветку реестра, куда пишет Пунто? Мало ли, могли накосячить в новой версии и закрыть какой-нить её параметр на запись. Я бы почистил реестр и переустановил бы версию. А потом проконтролировал запись параметров.
Сам Пунту юзаю чуть ли не с момента появления. Нравится. Стоит и дома, и на работе. Описанных косяков не замечено.