Система у Вас хотя бы в безопасном режиме загружается?
Если да, то загрузитесь, откройте "Мой компьютер", правой кнопкой мыши щёлкните на диске С > Свойства > Сервис > Проверка диска. Он скажет, что проверка будет при перезагрузке, согласитесь и перезагрузите. Придётся немного подождать. Обычно проходит за несколько минут, но может затянуться и на часы, и даже сутки, при этом на экране будет меняться информация, а светодиод обращения к винчестеру интенсивно мигать.
Если не удаётся загрузиться даже в безопасном режиме, значит надо скачать Hiren BootCD, внимание(!) версии 10. В нём загружаетесь в режиме BootCD, выбираете файл-менеджеры, Volcov Commander и режим с поддержкой NTFS и драйвером SysInternals, на запрос о проверке диска выбираете проверку.
Пробуйте и пишите о результатах.