Вам при установке систему поставили на диск D, а загрузочные файлы остались на C. Копировать boot.ini с диска на диск бесполезно, ведь в нем прописан только путь к папке с Windows и параметры для запуска. Можете с диска C удалить папку Windows и установить систему заново, только на C:. Затем можете очищать диск D.