По сути подойдет любая сборка минт или убунту. Лично мне нравится KDE но это не значит ничего. Тем более, что графическую надстройку можно тупо поменять на уже установленной системе.
1. Настроить все придется Вам. Все программы можно скачать из репы. Можно и без консоли. Для этой цели есть специальная программа.
2. Куда же без него. Практически везде есть.
3. Опера есть под никсы,
торрент есть из коробки почти во всех дистрибутивах причем работает лучше чем тот же uTorrent и без рекламы,
майл агент есть из коробки,
аська есть из коробки,
фаерфокс разрабатывался вначале под никсы. Есть из коробки (или устанавливается при первом запуске),
Скайп скачивается и устанавливается с оф сайта (из репы для минт) ,
tor Качается с оф сайта прекрасно себя чувствует на никсах ибо на базе того же огнелиса.
Все диски будут видны. А вот линуксовые разделы из под винды видны не будут. Для этого нужно устанавливать специальные драйвера.