Эти вирусы такие затейники...
Встречались такие экземплярчики, что мама не горюй. Мало того, что они облюбовали место для хранения своего тела на HDD/SSD в якобы повреждённых секторах, так они ещё свой загрузчик размещали в MBR, флешке с BIOS-ом и даже в энергонезависимой памяти южного моста.
Короче, прежде чем ставить ОС заново, возьмите Курейт или загрузочник Каспера и полностью проверьте бук.