Мухи отдельно, котлеты отдельно.
Питание на порты это одно, а работа с данными - совершенно другое.
Как вариант можно попробовать поставить контроллер PCI-USB, но не уверен, что поможет. Хотя изредка встречаются сочетания материнок и контроллеров, работающих так. Но скорее всего материнку в ремонт.
Скажите хоть её полное название, да и вообще конфигурацию, а то может дешевле выкинуть.