Я пользуюсь FileZilla. Очень удобно - можно перетаскивать файлы и папки не только внутри самой программы, но и наружу, в любую виндово-explorer'ную папку, и наоборот, из любой папки в окно программы, в нужное удаленное место.
Если что, брать тут:
http://filezilla-project.org/download.php?type=client
Там варианты под разные операционки.