Ставить можно как вертикально, так и горизонтально, на работе и сроке службы это никак не отразиться. Не рекомендуется ставить под наклоном, это единственное ограничение. Сейчас полно корпусов, в которых расположение винчестеров возможно только в вертикальной плоскости, мой корпус как раз из этой серии. И винты работают не первый год.