Не могу сказать ппц ей или не совсем ппц, если флешки восстанавливают прошивкой контролеера, значит, при чисто программном сбое, работоспособность можно восстановить, по логике. Нашёл ещё утилиту для низкоуровнего форматирования флешек с этим контроллером
http://altay.mybb.ru/viewtopic.php?id=268. Надо попробовать поработать с ней на другой машине, где флешка уверенно определялась на всех USB портах.
Как я понимаю, перед прошивкой сначала нужно файл конфигурации MP.ini отредактировать с помощью утилиты MPParamEdit_F1 или MPParamEdit_F2, в соответствии с нараметрами флешки, потом запустить утилиту прошивки MPALL_F1_0702_v363_00.exe, указать в ней файл конфигурации и нажать Update.