Системный жесткий диск из самой системы нельзя отформатировать обычными средствами, например из "Управления дисками" или командной строки. Можно из DOS`a, но для этого опять же нужна загрузочная дискета..... Отсюда выход: нужно найти любой установочный диск с ОС и отформатировать посредством запуска установщика системы, либо форматировать из другого раздела.