Жёсткий разбит на два раздела. В одном стоит Windows, программы и все системные дела. Второй раздел можно смело форматировать. При этом все данные второго раздела будут удалены. Он станет чистым, условно говоря. Тот раздел, где стоит Windows форматировать нельзя / не получится. Вообще то можно, но с переустановкой системы.