Я бы не советовал софтом различным "переразбивать" хард. Софтины эти навсамом деле создают виртуальный диск используя одновременно два или более реальных логических диска, в которых они ничего не меняют. Реальные разделы остаются прежними и файлы хранятся одновременно в нескольких разделах. Ненадёжно и ресурсы лишние кушает.
Лучше слить всю инфу с дисков C и D куда-нибудь и при следующей установке винды удалив эти разделы - создать два новых, с появившегося свободного пространства, и заново медленно отформатировать в NTFS. Самый надёжный метод.
В
Панель управления -> Администрирование -> Управление компьютером -> Управление дисками можно делать подобное со всеми не системными дисками.