не совсем понятно,если запускать харды по отдельности-винда грузится с обоих?
---------- Добавлено в 17:50 ---------- Предыдущее сообщение было написано в 17:41 ----------
Если мне не изменяет память то эта ошибка возникает когда в процессе операционной системы теряется доступ к источнику загрузки, т.е. к жесткому диску в вашем случае. Данные на этом жестком видны? Просканируйте его какой нить прогой например Victotia. Если бы сдох контроллер то винда бы и не начинала грузится.