Из этих папок и правда можно все удалять, сам проверял. В принципе из Config.MSI тоже можно, но может появиться проблема с удалением программ. Но если установлен Total Uninstall-это не важно. Кстати, РЕКОМЕНДУЮ ВСЕМ! Программы удаляет полностью.
www.martau.com Автор - Гаврила Мартау. Что насчет CCleaner? он расчитан так, что удаляет только то, что безопасно. У меня с ним никогда не было проблем. Другие хорошие программы-Glary Registry Repair, TuneUp Utilities. Checked by Computer-Bild and Crack-Brigade. Можно попробовать и WWR(Work With Registry). Последняя программа проверена только на WinХР.