1. Ни в коем случае ручками ничего не надо чистить в системных папках и в папке Windows!!!
2. Вообще да, осторожно надо. Но если ты установил CCleaner и ничего там не трогал в настройках, то по умолчанию там всё Ок должно быть. У меня тож CCleaner стоит, я так же поступаю: анализ - очистить. как раз CCleaner отвечает за твой 1-й вопрос.
По другому вопросу ничего ответить не могу.