Встречался с подобной проблемой на мамках Элитгруп. Это связано с автоматическим переопределением загрузочных устройств в BIOS при подключении дополнительного девайса.
Подключите второй жесткий диск, включите компьютер, зайдите в BIOS и выберите в качестве основного жесткого диска ваш первый винчестер с операционной системой. Выйдите с сохранением. Должно нормально заработать.