Перва-наперво, сделать резервную копию этих файлов.
Убедитесь, что пути, указанные в свойствах почтового ящика у ОЕ полностью совпадают с путями до файлов БД.
Далее, нужно проверить и восстановить (в случае повреждения) структуру этих БД. В интернете полно прог, которые это умеют делать.