Возьмите омметр, проверьте порты USB на материнской плате на короткое замыкание. Один щуп на Gnd, вторым каждый контакт прозвоните. В норме накоротко они звониться не должны. Прозвоните все USB-контакторы на материнской плате, они могут быть подключены к различным контроллерам "южника".
Естественно, все манипуляции проделывайте при обесточенном компьютере и вытащенной батарейке.