Полярность питания значения не имеет при правильной его трассировке.
Слаботочные сигнальные цепи не должны питаться по одним и тем же дорожкам с силовыми цепями. Для этого питание и корпус разводится отдельными проводниками, соединящимися в одной точке.
Далее - экранировка. Оберните всю плату усилителя куском
изолированной фольги и соедините её с корпусом в одной точке.
Что касается "Пиу" при выключении - это переходные процессы в схеме, вызванные изменением напряжения питания (разряд конденсаторов и пр.). Это устраняется специальным устройством, которое подключает колонки к усилителю с небольшой задержкой в 1-3 сек, а отключает мгновенно при нажатии кнопки питания.
В Вашем случае можно попробовать задействовать управляющий вход "Mute" на УМ.