Может быть, я и неправ, но мне кажется, что причина может быть только одна: самопроизвольно в фоне включается некий сервис, который забирает на себя ресурсы системы. И скорее всего, таковым является какая-то автообновлялка/проверялка как системы, так и приложений. Попробуйте это всё поотключать. И начать советую с глючного Software Updater в AVAST!. Возможно, им всё и ограничится.