Не знаю чего там присутствует при переполюсовке, мне с полярностью индикатора ошибаться пока не доводилось. А насчет прошивки, ее проще свою написать, чем в чужом исходнике баги вылавливать, да еще на асме, да с комментариями на английском.
Возьмите лучше схему и прошивку для частотомера Корабельникова под HD44780. Прошивка выверенная, и проверенная, не врет во всем диапазоне частот, гарантированно рабочая. Схема практически та же, только линии RS и R/W перекинуть, да кнопки чуть по другому подключить (кнопок всего две).
Если нужно, выложу архив со статьей и прошивками. Прошивки отдельные для частотомера и частотомера-цифровой шкалы.
Схема такая вот: